- ریاست پردیس
- معاونت آموزشی و تحصیلات تکمیلی
- معاونت پژوهشی
- معاونت فرهنگی و دانشجویی
- معاونت اداری و مالی
- روابط عمومی و امور بینالملل
- هیأت نظارت و ارزیابی آموزش عالی استان قم
- کمیته ارزیابی کیفیت پردیس
- نهاد نمایندگی مقام معظم رهبری
- شورای صنفی کارکنان
- اداره حراست
- مرکز علمی–فرهنگی پردیس فارابی دانشگاه تهران در مشهد مقدس
- بسیج اساتید و کارکنان